2022—2025年，上海市财政科技支出年均增幅超过20%，基础研究投入总体增长85%；“十四五”时期，上海全社会研发经费支出相当于全市生产总值的比例提高到4.5%左右。
经费大幅增长的背后，是近年来上海科技创新生态的持续优化。中国科学技术发展战略研究院编制的《中国区域科技创新评价报告2025》显示，上海的综合科技创新水平在各省区市中排名第一。这份报告的评价指标不以存量规模为主，而是用结构化指标反映各地创新投入产出和组织效率，客观评价地区创新生态的赋能水平。
用第五名投入获第一名产出
中国科学技术发展战略研究院介绍，《中国区域科技创新评价报告》基于科技部、国家统计局、国家外汇管理局等政府部门的统计数据，对全国31个省区市（不包含港澳台）的综合科技创新水平进行客观评价。报告评价结果已被多地纳入科技发展五年规划目标指标，构建了目前国内持续时间最长、最为稳定的区域创新能力评价体系。
在2025年报告中，位居榜首的上海得分为91.38，位次较上年提升1位，同比提高2.18个百分点。排名第二至第五的依次是北京、江苏、广东、浙江。
在科技活动产出方面，上海得分排名全国第一，创新产出水平和技术成果转化二级维度也均为第一。与上年相比，上海技术国际收入增长8.94%，占全国的34.22%，万元GDP技术国际收入增加2.07美元，保持在全国第一位；万人科技论文数、万人有效注册商标数、万人高价值发明专利拥有量、亿元GDP知识产权使用费出口额均保持全国第二位；技术市场输出技术成交额增长19.93%，万人输出技术成交额增加2891.97万元，位次上升至全国第二。
生物医药产业的BD（商务拓展）收入，是一类重要的技术国际收入。医药魔方的统计数据显示，2025年，中国创新药BD对外授权交易总金额达到1356.55亿美元，首付款70亿美元，交易总量为157笔。在交易数量上，上海位居榜首，占全国交易总量的1/3左右。
科技论文的质量和人均数量，上海也占有优势。2025年，上海科学家在《科学》《自然》《细胞》三大国际顶刊发表论文181篇，占全国的30.6%，较2024年增长14.6%。其中，上海科学家为第一作者或通讯作者的论文有109篇，占全国的24.1%，较2024年增长29.8%。
“值得注意的是，在科技创新投入这个指标上，上海排名全国第五，而在科技创新产出这个指标上排名第一，显示出上海科技创新组织的效率很高，支撑全链条创新的科技服务业发展快速，服务创新产出的生态优势明显。”上海市科学学研究所统计评价研究室主任张宓之说。

2025年全国各省区市综合科技创新水平指数（来源：《中国区域科技创新评价报告2025》）

高新技术产业效益大幅跃升
在创新人力资源方面，上海得分为100，位列全国第一。与上年相比，万人大专以上学历人数、万人R&D（科学研究与试验发展）研究人员数、基础研究人员投入强度指数均保持在全国第二；高校在校学生数增长5.30%，万人高校在校学生数增加17.20人，位次上升2位。
在创新物质条件方面，上海得分排名全国第二。与上年相比，仪器和设备支出增长40.82%，每名R&D人员仪器和设备支出增加1.06万元，位次上升4位；高技术产业固定资产净额占工业固定资产净额比重提高6.63个百分点，位次保持全国第一。
在高新技术产业效益方面，上海排名全国第三，比上年位次跃升13位。与上年相比，知识密集型服务业劳动生产率提高了8.41万元/人，知识产权密集型产业劳动生产率提高了11.13万元/人，工业战略性新兴产业劳动生产率提高了4.53万元/人。
上海高新技术产业的长足进步，表现在很多方面。“十四五”时期，上海全力推动集成电路、生物医药、人工智能三大先导产业的关键核心技术攻关。2024年，三大先导产业规模达到1.8万亿元，年均增速13.1%。为加快前沿技术和未来产业培育，市科委近年来探索建立项目经理人机制，围绕脑机接口、6G、量子计算等未来产业领域，实施项目、资金、人才、平台、政策一体化布局。去年10月，上海出台《关于加快推动前沿技术创新与未来产业培育的若干措施》，围绕未来制造、未来信息、未来材料、未来能源、未来空间、未来健康六大方向，构建“四位一体”工作机制，将创新成果从实验室推向产业应用。
两院院士和媒体负责人评选的2025年国内、国际十大科技新闻中，上海两家企业榜上有名，也体现了上海高新技术产业的创新实力：阶梯医疗与中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、复旦大学附属华山医院合作，成功开展了国内首例侵入式脑机接口前瞻性临床试验，使我国成为继美国之后，全球第二个将侵入式脑机接口技术推向临床试验的国家；曦智科技研发的光电混合计算加速卡PACE登上《自然》，这是一款集成16000多个光子元件的大型光子加速器，能在极低时延下完成复杂计算任务，展现了光子计算在真实场景中的可行性与高效性。在脑机接口、光子计算等前沿技术和未来产业领域，上海企业走在了世界前列。